同濟(jì)大學(xué)按照國務(wù)院常務(wù)會(huì)議精神，從2014年秋季學(xué)期起，向所有納入國家招生計(jì)劃的新入學(xué)研究生收取學(xué)費(fèi)。其中：工程管理碩士（125600）、MBA（125100）、MPA（125200）、法律碩士（非法學(xué)）（035101）、軟件工程碩士（085212）、金融碩士（025100）、會(huì)計(jì)碩士（125300）和翻譯碩士（055101、055102、055109）專業(yè)學(xué)位研究生的學(xué)費(fèi)標(biāo)準(zhǔn)另行公布，其它碩士研究生學(xué)費(fèi)為8000元/學(xué)年。

對(duì)全日制學(xué)術(shù)型研究生和全日制專業(yè)學(xué)位碩士研究生，同濟(jì)大學(xué)有完善的獎(jiǎng)助體系（工程管理碩士（125600）、MBA（125100）、MPA（125200）、法律碩士（非法學(xué)）（035101）、軟件工程碩士（085212）、金融碩士（025100）、會(huì)計(jì)碩士（125300）和翻譯碩士（055101、055102、055109）不納入獎(jiǎng)助體系中），對(duì)于納入獎(jiǎng)助體系的全日制學(xué)術(shù)型碩士生和全日制專業(yè)學(xué)位碩士生在入學(xué)時(shí)全部都可以獲得每年8000元的全額學(xué)業(yè)獎(jiǎng)學(xué)金，該獎(jiǎng)學(xué)金用以抵充學(xué)費(fèi)。對(duì)納入獎(jiǎng)助體系的碩士研究生還可獲得6000元/年的助學(xué)金。另外，全日制研究生都可以申請(qǐng)助教和助管的崗位，獲得額外的資助。所有全日制碩士研究生在學(xué)期間納入上海市城鎮(zhèn)居民基本醫(yī)療保險(xiǎn)，可申請(qǐng)辦理國家助學(xué)貸款，可參加有關(guān)專項(xiàng)獎(jiǎng)學(xué)金評(píng)定。

同濟(jì)大學(xué)工商管理碩士在職班、金融碩士在職班、公共管理碩士、工程管理碩士、會(huì)計(jì)碩士采取在職學(xué)習(xí)方式，考生錄取后，人事關(guān)系不轉(zhuǎn)入學(xué)校，在讀期間不參加上海市大學(xué)生醫(yī)療保障，學(xué)校不安排住宿，畢業(yè)時(shí)不納入就業(yè)計(jì)劃。

同濟(jì)大學(xué)碩士研究生學(xué)制一般為2.5 年（工商管理碩士普通項(xiàng)目、中印美Global MBA項(xiàng)目、公共管理碩士、金融碩士、會(huì)計(jì)碩士、翻譯碩士、藝術(shù)碩士為2年；風(fēng)景園林碩士、生物學(xué)、工商管理碩士同濟(jì)-曼徹斯特MBA雙學(xué)位項(xiàng)目、法律碩士（非法學(xué)）為3年；醫(yī)學(xué)院與口腔醫(yī)學(xué)院招生專業(yè)均為3年），修讀年限最長為4年。中德學(xué)院、中法工程和管理學(xué)院另有語言強(qiáng)化班，需時(shí)半年。